Criando redes de estrutura de proteínas 3D usando Pytho…

Usando a rede de contatos RING para fabricar PSNs 3D

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Conforme prometido na secção 1, oriente item fornecerá um script Python para processar o registo de texto .json gerado uma vez que saída pelo Residue Interaction Network Generator (ANEL) e, em seguida, plote os dados uma vez que uma rede de estrutura de proteína 3D (PSN) usando Plotamente. Na Segmento 1 descrevemos em detalhes o diagrama de fluxo de trabalho mostrado aquém para gerar um PSN 3D usando scripts Python para processar o registo json gerado pelo RING. Porquê grande secção do código da Segmento 2 é semelhante em estrutura à Segmento 1, o leitor deve se sentir esperançoso em simplesmente reproduzir e grudar o código em um registo .py e executar o script – muito simples. O registo json mostrado cá pode ser gerado usando as etapas descritas na Segmento 1 ou você pode decrescer o registo de texto em Sua visita nos ajuda a continuar oferecendo o melhor para você! rel="nofollow noopener" target="_blank" class="af ov" href="https://github.com/LastCodeBender42/Medium/tree/main/creating-3d-protein-structure-networks-part1">GitHub. Porquê oriente item é resumido, entrarei em mais detalhes sobre o que o código está fazendo. Primeiro, lembre-se da secção 1 que o .json O registo de rede de contato mencionado nesta história foi gerado no pipeline diagramado aquém:

Convertendo o registo JSON em uma rede 3D